Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gga1Q8R0H9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms