Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms