Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml1Q8K558 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms