Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms