Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot6Q8K3P5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms