Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scara5Q8K299 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scara5Q8K299 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scara5Q8K299 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scara5Q8K299 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scara5Q8K299 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Scara5Q8K299 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara5Q8K299 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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