Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Mtmr3Q8K296 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Mtmr3Q8K296 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Mtmr3Q8K296 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Mtmr3Q8K296 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Mtmr3Q8K296 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Mtmr3Q8K296 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Mtmr3Q8K296 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Mtmr3Q8K296 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Mtmr3Q8K296 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Mtmr3Q8K296 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Mtmr3Q8K296 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtmr3Q8K296 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms