Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek9Q8K1R7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nek9Q8K1R7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms