Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1N2

Phldb2, Pleckstrin homology-like domain family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb2Q8K1N2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phldb2Q8K1N2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phldb2Q8K1N2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms