Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms