Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sphk1Q8CI15 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sphk1Q8CI15 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sphk1Q8CI15 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk1Q8CI15 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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