Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS8

Vps37a, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37aQ8CHS8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps37aQ8CHS8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps37aQ8CHS8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms