Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ep400Q8CHI8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ep400Q8CHI8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms