Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp27Q8CEG8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms