Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28bQ8CEG5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms