Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms