Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms