Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacnb2Q8CC27 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms