Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf170Q8CBG9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf170Q8CBG9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf170Q8CBG9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf170Q8CBG9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf170Q8CBG9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf170Q8CBG9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf170Q8CBG9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Rnf170Q8CBG9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf170Q8CBG9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf170Q8CBG9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf170Q8CBG9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf170Q8CBG9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnf170Q8CBG9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnf170Q8CBG9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf170Q8CBG9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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