Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms