Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930572O03RikQ8C5Y0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930572O03RikQ8C5Y0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms