Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ccdc113Q8C5T8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ccdc113Q8C5T8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ccdc113Q8C5T8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ccdc113Q8C5T8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc113Q8C5T8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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