Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Snx16Q8C080 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Snx16Q8C080 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Snx16Q8C080 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Snx16Q8C080 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx16Q8C080 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms