Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY35

Fgd2, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd2Q8BY35 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fgd2Q8BY35 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fgd2Q8BY35 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms