Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn17Q8BXA6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms