Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TtpaQ8BWP5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtpaQ8BWP5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms