Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms