Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap4Q8BMK4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms