Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab3gap2Q8BMG7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab3gap2Q8BMG7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab3gap2Q8BMG7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab3gap2Q8BMG7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab3gap2Q8BMG7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms