Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf18Q8BM39 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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