Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc2Q8BKV1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms