Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU0

Sgta, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtaQ8BJU0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SgtaQ8BJU0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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SgtaQ8BJU0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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SgtaQ8BJU0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SgtaQ8BJU0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SgtaQ8BJU0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SgtaQ8BJU0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SgtaQ8BJU0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SgtaQ8BJU0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgtaQ8BJU0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms