Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup93Q8BJ71 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms