Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmco3Q8BH01 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms