Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms