Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc172Q810N9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms