Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ell3Q80VR2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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