Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul9Q80TT8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul9Q80TT8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms