Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf8Q80TJ7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms