Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms