Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms