Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms