Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2lQ7TS74 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms