Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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LnpkQ7TQ95 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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LnpkQ7TQ95 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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LnpkQ7TQ95 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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LnpkQ7TQ95 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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LnpkQ7TQ95 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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LnpkQ7TQ95 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LnpkQ7TQ95 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms