Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms