Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp397Q7TNK4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms