Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx4Q7TNK1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx4Q7TNK1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms