Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN12

Inava, Innate immunity activator protein, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InavaQ7TN12 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InavaQ7TN12 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
InavaQ7TN12 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms