Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SyncripQ7TMK9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms