Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpv1Q704Y3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv1Q704Y3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms